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壁那几个厂也都是这样。说实话,我们都怀疑他们那专利有问题,按理说不可能复现不了的。”
“啊?”卢赫一时间消化不了。
“哎呀,就是这样。您是我们老客户了,才跟您说这么多。不过没有锌指也无所谓,我们这边建议您还是用cRISpR吧,又简单效率又高。没必要去死磕那种20年前的老古董。”
“好吧,谢了啊老高。”
“不客气不客气,有什么需要尽管联系我。”
卢哥挂掉电话,扯掉浴巾,又开始挠头,“专利还能有假?真当审查员是吃白饭的吗?”
“就是!”菜菜也不屑地说,“三个碱基对应一个氨基酸,dNA就只有四种碱基,理论上只有64种氨基酸序列,也就区区64种锌指来回组合,dNA的GpS不就有了吗?这有什么难的啊?”
卢赫听后不可思议地吸了一口凉气,摇着头拉过一把椅子,示意菜菜坐下。他满脸慈爱地看着眼前这个头脑和四肢都简单只有10根手指头发达的傻姑娘,说:“来,让为师考考你,你先说说,什么是锌指技术?”
菜菜一脸你绝对考不住我地回答道:“首先,根据‘中心法则’,基因组dNA通过转录和翻译两个步骤知道蛋白质生产。其中,转录指基于dNA模板的RNA合成,翻译指基于RNA模板的蛋白质合成,进而决定了我们的性状。”
“你曾经的偶像罗伯特·里德还发现,在RNA的合成过程种,有一种聚合酶起了关键作用。它就像生产流水线上的装配工人,根据包工头dNA提供的图纸,一个碱基、一个碱基地组装连接成RNA长链。”
“其次,里德还发现,RNA的生产过程中,除了dNA、RNA聚合酶和碱基原料以外,还存在一个叫做tFIIIA的转录因子。它就像一个指挥官,告诉RNA聚合酶从dNA图纸的哪里开始组装。这就解释了为什么所有体细胞都共享一个基因组,但血红蛋白只能在红细胞内合成,胰岛素只能在胰岛β细胞中生产。”
“最后,艾伦·克鲁格发现,tFIIIA之所以可以特异性结合dNA,是因为它有个dNA识别模块。其中数十个氨基酸围绕在游离的锌离子周边,形成一个像手指一样的立体结构,这就是锌指。”
“很好。”卢赫连连点头,“然后呢?”
“然后?然后不就是一个锌手指能够识别三个碱基序列,把多个锌手指组合在一起,连接上核酸内切酶,不就能完成特异性识别并且咔嚓一下子剪断dNA了嘛?”
菜菜说完得意地眨着眼睛望着卢赫,好像在说:快表扬我。
“没了?”卢赫追问道。
“没啦呀。3个碱基表征一个氨基酸,理论上氨基酸也就只有64种,找到对应的64个锌手指,排列组合在一起,实现对靶标基因的精确定位。”
“唉。。。”卢赫叹气道,“姑娘你还是太年轻。言之易,行之难。我之前总跟你说锌指组装起来很难你知道为什么吗?”
“对呀!为什么呀?按原理来看,组装锌指不就是有手就能干的事嘛?”
“因为锌指之间是会互相干扰的。比如,你想要组一个能特异性识别GGtAAGAtc的锌指。你以为是把GGt、AAG、Atc对应的三个锌指粘起来就行了吗?不是的。锌指之间会互相干扰,GGt的锌指会稍微摸到AGG的A一点,同样Atc的锌指也会暗戳戳地碰一下AGG的G,反之亦然。这相当于有效的识别序列被模糊成了GGNNANNtc,使特异性结合的能力大大下降,脱靶能脱到姥姥家去。”
菜菜听后蹙起眉头,嘟着嘴默默沉思。
“不过克鲁格找到了一个十分‘优雅’的方式,解决了这个问题。每一个3碱基序列都有可能对应多个锌手指,早在30年前就积累出大几百个了,总能找到两个能和谐共处的锌指。对于GGtAAGAtc来说,可以先找到和谐相处的GGt-AAG(A),再找到和谐相处的AAG(b)-Atc,最终再搜寻出一个AAG(c)使它和AAG(A)、AAG(b)结构类似,问题就解决了。”
“通过6个人就能认识全世界?”菜菜惊叹道。
“没错,就是这个道理。”卢赫点头称赞,“不过,虽然原理简单,但做起来很难。实际的锌指组装是一个极其困难且复杂的过程。我现在让你立刻要到马花腾的联系方式,并通知他赶紧V我50,你办得到吗?”
菜菜信服地摇了摇头。
“所以啊,这就是圣加蒙锌指专利的核心之处,快速设计和组装锌指。”
“那你之前为什么总说自己用锌指编辑火焰龟很难,是试了几千次冒碰出来的?”菜菜毫不客气地击中了卢赫的痛处。
卢赫把浴巾蒙到脸上,含糊不清地说:“这就是问题所在啊。圣加蒙垄断锌指技术这么多年,好不容易专利过期了,还仿不出来。现在想来,虽然我当初试了那么多次才成功,但倘若我不用他们的平台,我跟金哥永远都没有缘分相见。”
菜菜眼见着面前这个好不容易走出阴霾,又重归垂头丧气的人,连忙安慰道:“那我们买一套吧,买一套他们的组装平台。现在靶标基因位点和锌指数据都是现成的,你再组装一个编辑出金哥二世不是分分钟的事嘛?”
但她没想到是,卢赫听后竟更加抓狂了,他把浴巾从脸上拽下一半,忧郁地望着菜菜,“首先,他们不卖了。其次,卖我我也买不起。最后,我没有编辑金哥的锌指数据。当初在南州湾里德实验室用的他们的平台,是一体化的。你给它dNA序列和靶标基因,试剂盒一塞,它直接给你出合成结果。这是为了保护他们的商业机密。”
卢赫说完,两人同时陷入了沉默。他们现在的处境完全就是:我有一个很棒的想法,但我还差一个程序员。
卢赫的头顶冒着蒸蒸的水汽,水汽袅袅上升把头顶的白炽灯晕得一片模糊。他就这么仰着头,对着灯光发呆。
忽然,他的脑海中忽然闪过一瞬他看过不久的一篇论文。那是一篇用cRISpR技术编辑模板小鼠的文章,里面的对照组用的是锌指,通讯作者的单位是南州湾大学。当初里德实验室买下锌指平台时是永久授权,他们现在还在用!
他心中立刻冒出一个大胆的想法,“你说,我回到南州湾大学借着他们的平台去把金哥二世、莉莉白和皮卡丘一起造出来,这怎么样?”
菜菜狐疑地瞥了一眼卢赫,好似对方是一个异想天开的傻子:“您老年纪太大估计都已经忘了,里德那栋楼里可是有个三级实验室,进楼需要一道安检、一道刷卡闸机和一道人脸识别。请问您是打算偷摸溜进去还是硬闯呀?”
卢赫笑着摇头,“都不是,我是五好青年,我打算正大光明地进去。”
“那要怎么进去呀?”
“考进去!”
壁那几个厂也都是这样。说实话,我们都怀疑他们那专利有问题,按理说不可能复现不了的。”
“啊?”卢赫一时间消化不了。
“哎呀,就是这样。您是我们老客户了,才跟您说这么多。不过没有锌指也无所谓,我们这边建议您还是用cRISpR吧,又简单效率又高。没必要去死磕那种20年前的老古董。”
“好吧,谢了啊老高。”
“不客气不客气,有什么需要尽管联系我。”
卢哥挂掉电话,扯掉浴巾,又开始挠头,“专利还能有假?真当审查员是吃白饭的吗?”
“就是!”菜菜也不屑地说,“三个碱基对应一个氨基酸,dNA就只有四种碱基,理论上只有64种氨基酸序列,也就区区64种锌指来回组合,dNA的GpS不就有了吗?这有什么难的啊?”
卢赫听后不可思议地吸了一口凉气,摇着头拉过一把椅子,示意菜菜坐下。他满脸慈爱地看着眼前这个头脑和四肢都简单只有10根手指头发达的傻姑娘,说:“来,让为师考考你,你先说说,什么是锌指技术?”
菜菜一脸你绝对考不住我地回答道:“首先,根据‘中心法则’,基因组dNA通过转录和翻译两个步骤知道蛋白质生产。其中,转录指基于dNA模板的RNA合成,翻译指基于RNA模板的蛋白质合成,进而决定了我们的性状。”
“你曾经的偶像罗伯特·里德还发现,在RNA的合成过程种,有一种聚合酶起了关键作用。它就像生产流水线上的装配工人,根据包工头dNA提供的图纸,一个碱基、一个碱基地组装连接成RNA长链。”
“其次,里德还发现,RNA的生产过程中,除了dNA、RNA聚合酶和碱基原料以外,还存在一个叫做tFIIIA的转录因子。它就像一个指挥官,告诉RNA聚合酶从dNA图纸的哪里开始组装。这就解释了为什么所有体细胞都共享一个基因组,但血红蛋白只能在红细胞内合成,胰岛素只能在胰岛β细胞中生产。”
“最后,艾伦·克鲁格发现,tFIIIA之所以可以特异性结合dNA,是因为它有个dNA识别模块。其中数十个氨基酸围绕在游离的锌离子周边,形成一个像手指一样的立体结构,这就是锌指。”
“很好。”卢赫连连点头,“然后呢?”
“然后?然后不就是一个锌手指能够识别三个碱基序列,把多个锌手指组合在一起,连接上核酸内切酶,不就能完成特异性识别并且咔嚓一下子剪断dNA了嘛?”
菜菜说完得意地眨着眼睛望着卢赫,好像在说:快表扬我。
“没了?”卢赫追问道。
“没啦呀。3个碱基表征一个氨基酸,理论上氨基酸也就只有64种,找到对应的64个锌手指,排列组合在一起,实现对靶标基因的精确定位。”
“唉。。。”卢赫叹气道,“姑娘你还是太年轻。言之易,行之难。我之前总跟你说锌指组装起来很难你知道为什么吗?”
“对呀!为什么呀?按原理来看,组装锌指不就是有手就能干的事嘛?”
“因为锌指之间是会互相干扰的。比如,你想要组一个能特异性识别GGtAAGAtc的锌指。你以为是把GGt、AAG、Atc对应的三个锌指粘起来就行了吗?不是的。锌指之间会互相干扰,GGt的锌指会稍微摸到AGG的A一点,同样Atc的锌指也会暗戳戳地碰一下AGG的G,反之亦然。这相当于有效的识别序列被模糊成了GGNNANNtc,使特异性结合的能力大大下降,脱靶能脱到姥姥家去。”
菜菜听后蹙起眉头,嘟着嘴默默沉思。
“不过克鲁格找到了一个十分‘优雅’的方式,解决了这个问题。每一个3碱基序列都有可能对应多个锌手指,早在30年前就积累出大几百个了,总能找到两个能和谐共处的锌指。对于GGtAAGAtc来说,可以先找到和谐相处的GGt-AAG(A),再找到和谐相处的AAG(b)-Atc,最终再搜寻出一个AAG(c)使它和AAG(A)、AAG(b)结构类似,问题就解决了。”
“通过6个人就能认识全世界?”菜菜惊叹道。
“没错,就是这个道理。”卢赫点头称赞,“不过,虽然原理简单,但做起来很难。实际的锌指组装是一个极其困难且复杂的过程。我现在让你立刻要到马花腾的联系方式,并通知他赶紧V我50,你办得到吗?”
菜菜信服地摇了摇头。
“所以啊,这就是圣加蒙锌指专利的核心之处,快速设计和组装锌指。”
“那你之前为什么总说自己用锌指编辑火焰龟很难,是试了几千次冒碰出来的?”菜菜毫不客气地击中了卢赫的痛处。
卢赫把浴巾蒙到脸上,含糊不清地说:“这就是问题所在啊。圣加蒙垄断锌指技术这么多年,好不容易专利过期了,还仿不出来。现在想来,虽然我当初试了那么多次才成功,但倘若我不用他们的平台,我跟金哥永远都没有缘分相见。”
菜菜眼见着面前这个好不容易走出阴霾,又重归垂头丧气的人,连忙安慰道:“那我们买一套吧,买一套他们的组装平台。现在靶标基因位点和锌指数据都是现成的,你再组装一个编辑出金哥二世不是分分钟的事嘛?”
但她没想到是,卢赫听后竟更加抓狂了,他把浴巾从脸上拽下一半,忧郁地望着菜菜,“首先,他们不卖了。其次,卖我我也买不起。最后,我没有编辑金哥的锌指数据。当初在南州湾里德实验室用的他们的平台,是一体化的。你给它dNA序列和靶标基因,试剂盒一塞,它直接给你出合成结果。这是为了保护他们的商业机密。”
卢赫说完,两人同时陷入了沉默。他们现在的处境完全就是:我有一个很棒的想法,但我还差一个程序员。
卢赫的头顶冒着蒸蒸的水汽,水汽袅袅上升把头顶的白炽灯晕得一片模糊。他就这么仰着头,对着灯光发呆。
忽然,他的脑海中忽然闪过一瞬他看过不久的一篇论文。那是一篇用cRISpR技术编辑模板小鼠的文章,里面的对照组用的是锌指,通讯作者的单位是南州湾大学。当初里德实验室买下锌指平台时是永久授权,他们现在还在用!
他心中立刻冒出一个大胆的想法,“你说,我回到南州湾大学借着他们的平台去把金哥二世、莉莉白和皮卡丘一起造出来,这怎么样?”
菜菜狐疑地瞥了一眼卢赫,好似对方是一个异想天开的傻子:“您老年纪太大估计都已经忘了,里德那栋楼里可是有个三级实验室,进楼需要一道安检、一道刷卡闸机和一道人脸识别。请问您是打算偷摸溜进去还是硬闯呀?”
卢赫笑着摇头,“都不是,我是五好青年,我打算正大光明地进去。”
“那要怎么进去呀?”
“考进去!”